花卉合并是花圃育种玩法的核心机制。玩家需要掌握不同花卉的初始颜色、合成路径以及变异概率，才能高效培育出稀有品种。花卉合并的基本规则是：将两种同类型但不同颜色的花卉放入培育台，消耗取粉笔后可能产生新颜色。需亲本添加顺序会影响最终结果，即使配方相同，先后顺序不同也可能导致花色差异。
绣球花的基础颜色为红与白，通过红+白可合成绿色普通种，而紫色、蓝色和粉色属于稀有品种。百合花初始拥有红、白、黄三色，其稀有品种包括橘黄、蓝、粉，培育时需注意黄+紫组合有较高概率产出橘黄百合。花菱草的稀有合成种为浅粉、紫、蓝，其中紫色可通过浅粉+浅粉或红+红获得。鸢尾花的初始色为白与紫，其稀有品种绿白、橘黄和粉白需通过特定顺序组合培育。
育种过程中存在随机性，相同配方和顺序也可能产生不同结果。建议优先使用标红的高概率组合，如百合的橘黄=黄+紫，花菱草的紫=浅粉+浅粉。每次育种都会消耗取粉笔，该道具可在游乐杂货铺用玥琅购买，或通过山遇商店消耗青田玉坠获取。稀有花合成后务必使用取苗剪保留种子，作为后续培育的备用资源。
花卉生长分为种子、花苗、成花三个阶段。花苗期可通过浇水施肥缩短成熟时间，拜访好友家园照料其花苗也有概率获得对方品种的种子。成花可用于家园装饰、制作香丸或赠送村民提升好感度。制作香丸需搭配对应等级香料，香丸品质受花卉和香料等级共同影响，高品质香丸能显著提升生产效率。
对于菊花、石蒜、报春花等特殊品种，其合并规则更为复杂。例如菊花存在十种颜色，黄白菊需通过黄+白或紫+白合成；石蒜粉白+粉白可产出石蒜蓝；报春花则需要注意红+绿组合对多种颜色的影响。建议建立系统的培育记录，跟踪各品种的成功率组合，逐步完善图鉴收集。花艺等级提升后，可解锁更多初始种子购买权限，为育种提供更多可能性。
